研究確定了神經(jīng)母細(xì)胞瘤中的關(guān)鍵細(xì)胞亞群和相關(guān)基因特征
神經(jīng)母細(xì)胞瘤 (NB) 是兒童中最常見的顱外實(shí)體腫瘤,由于其轉(zhuǎn)移性和高度異質(zhì)性,給治療帶來了巨大的挑戰(zhàn)。最近一項(xiàng)利用單細(xì)胞 RNA 測(cè)序 (scRNA-seq) 的研究揭示了 NB 進(jìn)展和轉(zhuǎn)移背后的重要分子機(jī)制,為潛在的治療靶點(diǎn)提供了啟示。
該研究分析了 NB 患者的原發(fā)性腫瘤和匹配的轉(zhuǎn)移瘤,揭示了負(fù)責(zé)啟動(dòng)轉(zhuǎn)移的腫瘤細(xì)胞“啟動(dòng)”亞群。該研究發(fā)表在《醫(yī)學(xué)前沿》雜志上。
通過應(yīng)用各種分析方法,包括進(jìn)化軌跡分析和細(xì)胞狀態(tài)分化預(yù)測(cè),該研究描繪了 NB 的轉(zhuǎn)錄景觀并確定了與不良預(yù)后相關(guān)的特征。
該研究收集了六名 NB 患者的腫瘤樣本,包括原發(fā)部位和轉(zhuǎn)移部位。這些樣本經(jīng)過 scRNA-seq 處理,生成了全面的單細(xì)胞表達(dá)圖譜。分析發(fā)現(xiàn)了 11 個(gè)不同的簇,每個(gè)簇都有獨(dú)特的轉(zhuǎn)錄特征,突顯了 NB 的異質(zhì)性。
通過推斷的拷貝數(shù)變異(CNV)分析和全基因組測(cè)序(WGS),將惡性細(xì)胞與非惡性細(xì)胞區(qū)分開來,從而有助于更深入地了解腫瘤細(xì)胞群。
該研究的軌跡分析確定了一個(gè)特定的細(xì)胞群,稱為起始細(xì)胞,可能是 NB 轉(zhuǎn)移擴(kuò)散的啟動(dòng)者。這些細(xì)胞在原發(fā)性腫瘤和轉(zhuǎn)移性腫瘤中均有發(fā)現(xiàn),具有高增殖能力,并且具有活躍的細(xì)胞周期和 DNA 修復(fù)途徑。
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