小兒實體瘤約占所有兒童癌癥的40%。雖然小兒癌癥很少見，但兒童可以發(fā)展出多種腫瘤類型，位于身體的不同部位，這使得鑒別診斷具有挑戰(zhàn)性。洛杉磯兒童醫(yī)院的研究人員開發(fā)了一種用于實體瘤的液體活檢，當(dāng)手術(shù)或組織活檢不可行時，它有可能幫助得出特定的診斷。研究結(jié)果發(fā)表在npj Precision Oncology雜志上。

“這是兒科學(xué)術(shù)醫(yī)療中心推出的首批經(jīng)過臨床驗證的液體活檢測試之一，”CHLA基因組醫(yī)學(xué)主任兼?zhèn)€性化醫(yī)學(xué)中心主任Jaclyn Biegel博士說。

“我們創(chuàng)建了一個測試，可能有助于做出診斷，確定預(yù)后，并可能確定實體瘤兒童的有效治療方法，”CHLA癌癥和血液疾病研究所臨床研究醫(yī)學(xué)主任Fariba Navid博士說。Navid博士和Biegel博士是這項研究的共同資深作者。

需要對兒童腫瘤進(jìn)行特異性檢查，因為影響成人的腫瘤的遺傳學(xué)與兒童不同。成人腫瘤往往是由突變引起的 - 基因中基于序列的變化 - 因此大多數(shù)液體活檢測試都是專門為識別這些突變而開發(fā)的。然而，由突變引起的兒科腫瘤不太常見。在兒童中，拷貝數(shù)變化 - 丟失或擁有一個或多個基因的額外拷貝 - 或?qū)е禄蛉诤系幕蛑嘏?，更具特征性?/p>

在他們的研究中，CHLA團隊將一種稱為低通全基因組測序(LP-WGS)的技術(shù)與血漿中游離DNA的靶向測序相結(jié)合，以檢測拷貝數(shù)變化以及突變和基因融合，這是小兒實體瘤的特征。

該研究的一個重要特點是，它需要的樣本量比成人液體活檢研究所需的樣本量小得多。由于嬰兒或幼兒的血容量較小，因此需要縮小測定以適應(yīng)這種差異。

為了創(chuàng)建測試，研究人員與CHLA的臨床團隊和研究人員合作，包括眼部腫瘤學(xué)和CHLA視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤項目主任Jesse Berry醫(yī)學(xué)博士，以及參與腫瘤學(xué)，神經(jīng)外科和病理學(xué)和實驗室醫(yī)學(xué)的研究人員。CHLA癌癥和血液疾病研究所副所長Leo Mascarenhas，醫(yī)學(xué)博士，MS也參與了該項目的設(shè)計和支持。

該測試的第一個版本于 2022 年 <> 月推出，評估血液樣本、腦脊液和眼睛房水中的染色體拷貝數(shù)變化，以分別幫助實體瘤、腦腫瘤和視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤患者的臨床診斷。

下一個版本的臨床測定將在大約六個月內(nèi)提供，將包括突變和基因融合的檢測。

基于液體活檢的基因檢測加入了CHLA開發(fā)的OncoKids癌癥小組，這是一種基于測序的下一代檢測方法，旨在檢測與兒童白血病、腦和實體瘤相關(guān)的DNA或RNA變化;CHLA 癌癥易感性小組;癌癥RNAseq，一種使用RNA測序的基于轉(zhuǎn)錄組的測定;VMD4Kids，血管和鑲嵌疾病的面板;以及基于甲基化陣列的小兒腦腫瘤分析。